中医学术与气功学术有本质的内在联系，他们的古典哲学基础，即其世界观和方法论的基础一脉相承、基本一致。二者的应用目的也有相通之处，气功修炼的养生和治疗效果自古以来一直为中医所采用。传统用医药学将气功作为一种疗法的历史可以追溯到中医药学产生之初的远古时代。在古典气功学术体系中，以中医药学理论作为指导的气功学术流派即医家气功，现代的中医气功学就是在继承古代医家气功学术的基础上，随着时代的发展，逐步融入现代科学理论与技术而推陈出新的中医学科，其学科性质与针灸学、推拿学等相当，属于临床应用学科。
    在中医学史上，历代卓有成就的大医家几乎都精通气功学术，如春秋战国时期的扁鹊，汉代的华佗、张仲景，隋代的巢元方，唐代的孙思邈、王焘，金元四大家刘完素、张子和、李东垣、朱丹溪，明代的李时珍、杨继洲，清代的叶天士、吴鞠通，民国时期的张锡纯等。这些医家几乎都对中医学术做出过开拓性的贡献，都是中医学史上不可或缺的杰出人物，是他们所处的时代中医学术的栋梁与精英。这些医家的著作中都有关于气功的论述，或阐明理论，或记载临床应用，观点明确，应用纯熟。其中的一些著作不仅是中医学术史上的经典之作，而且在气功学术史上也占有重要地位，例如巢元方的《诸病源候论》和李时珍的《奇经八脉考》。历代大医家们对气功学术的重视与研究，足以表明中医与气功在学术高层次上本质的、必然的联系与沟通，具有深刻的意义和持久的影响。
    中医古籍中包含有众多的气功学术文献。《黄帝内经》中明确提到导引、行气等气功理论及治疗的就有8篇，其论述精当，有重要的指导有意义。例如《素问•上古天真论》说：“余闻上古有真人者，提挈天地，把握阴阳，呼吸精气，独立守神，肌肉若一，故能寿蔽天地，无有终时，此其道生。”这42个字高度概括了古典气功的基本理论和方法，从中可以看出现代气功三调合一观念的雏形。从研究气功学术的角度在浩如烟海的中医古籍中搜寻，除《黄帝内经》之外，记载和论述气功疗法内容较多的医学著作有南北朝时期陶弘景的《养性延命录》、隋代巢元方的《诸病源候论》、唐代孙思邈的《备急千金要方》、宋代由政府主持编篡的《圣济总录》、明代冷谦的《修龄要旨》及高濂的《遵生八笺》、清代沈金鳌的《杂病源流犀烛》等。这些著作在理论、操作、应用诸方面对气功疗法的形成及发展均有所建树，可以说是中医气功学术的主要源泉。在这些古典医籍中特别值得一提的是《诸病源候论》，这部由隋代太医令巢元方所著的病因病机学专著，同时也是一部古代气功疗法的专著，其书中对各类疾病的治疗只用气功疗法，未提及任何药方、针灸等其他疗法。
    当代中医界重视气功的医家和学者也大有人在。早在20世纪60年代，秦伯未、任应秋等著名中医学家上书卫生部提出中医教学改革计划时，即提出要及早开设气功课程。80年代以后，已有10余所中医药院校开设了气功课程，北京中医学院和上海中医学院还设立了气功研究所。气功进入中医药高等教育体系和建立科研机构为中医气功学的学科建设和发展奠定了扎实的基础。1994年7月，由全国10余所高等中医药院校和科研机构协作编写的《中医气功学》教材由人民卫生出版社出版。这是新中国成立以来的第一本，也是唯一一本由多所大学和科研单位集体编写并广泛使用的中医气功学教材，是中医气功学学科建设迈出的标志性步骤。2005年8月，新世纪全国高等中医药院校规划教材《中医气功学》由中国中医药出版社出版。从协编教材到规划教材，是中医气功学学科建设的又一进步，说明中医气功学的学术体系经过10余年的锤炼，已经日臻成熟，能够与中医药学的其他学科比肩而立、并驾齐驱。
    与气功学术的总体相比较，中医气功学有其自身的一些特点。例如，在指导思想上虽以中医理论为基础，但因气功现代研究的需要，也兼顾西医理论和现代科学理论。又如作为一种疗法，其目的是明确和限定的，即养生与治疗，但古典气功修炼的母的不仅限于此。另应注意，养生与治疗既有联系又有区别，前者通常是指健康人的保健和延缓衰老，后者是指对于疾病患者的治疗。现代的中医气功学比较侧重于治疗，这与古代各家的气功修炼也有所不同。此外，中医气功学在功法的选择上博采众家、不拘一格，除古代的医家功法之外，凡能够发挥养生和治疗目的的气功功法，无论其起源于佛家、道家、儒家或其他各家，均予选用。
    综上所述，中医气功学是一门研究中医药学领域内气功学术的历史发展、基础理论、操作技能及临床应用及其原理的学科。（文摘刘天君主编《中医气功学》，中国中医药出版社2012年8月第3版，2013年1月第2次印刷。）